注册医疗器械公司，办理的流程与一般公司注册基本上没有什么不同。首先是要确定公司注册资本、经营范围、公司名称、注册地址、出资比例等，然后进行公司名称的核准。核准通过之后，就可以携带相应的注册材料，连同注册申请一同提交（线上提交或者是现场窗口提交）。等待审核通过后，就可以领取营业执照。最后就是办理刻章、开户、申领发票、核定税种等事项。
医疗器械公司注册下来后，想要正常经营，还需要去做一件事请——办理许可证。
根据办理的许可证类型不同，需要符合的条件也不一样。比如说申请《医疗器械经营企业许可证》应当同时具备下列条件:
1.具有与经营规模和经营范围相适应的质量管理机构或者大专学历以上质量管理人员两个。质量管理人员应当具有国家认可的相关专业学历或者职称。
2.具有与经营规模和经营范围相适应的相对独立的经营场所。
3.具有与经营规模和经营范围相适应的储存条件，包括具有符合医疗器械产品特性要求的储存设施、设备。
4.应当建立健全产品质量管理制度，包括采购、进货验收、仓储保管、出库复核、质量跟踪制度和不良事件的报告制度等。
5.应当具备与其经营的医疗器械产品相适应的技术培训和售后服务的能力，或者约定由第三方提供技术支持。
开办第二、三类医疗器械经营企业，应向经营所在地食品药品监管分局申请并提交以下资料:
(1)《深圳市医疗器械经营企业许可证申请表》;
(2)《医疗器械经营企业许可证申请材料登记表》;
(3)工商行政管理部门出具的企业名称预核准证明文件或《营业执照》复印件(校验原件);
(4)拟办企业质量管理负责人的身份证、学历或者职称证明复印件及个人简历;
(5)拟办企业质量管理人员的身份证、学历或者职称证明复印件;
(6)拟办企业组织机构与职能或专职质量管理人员的职能;
(7)拟办企业注册地、仓库的地理位置图、平面图(注明面积)、房屋产权证明或者租赁协议(附租赁房屋产权证明，下同)复印件;
(8)拟办企业产品质量管理制度文件及储存设施、设备目录。
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